中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所，始建于1958年，原名日坛医院，1963年增设肿瘤研究所，此后又相继建立了河南林州、江苏启东等肿瘤高发防治现场。1983年迁至北京市东南龙潭湖畔。正式更名为中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所。院所是建国以来第一个肿瘤专科医院也是亚洲地区最大的肿瘤防治研究中心，是世界卫生组织癌症研究合作中心之一，也是国家药品监督管理局国家药品临床研究基地。院所集肿瘤医疗、科研、教学为一体，全方面进行肿瘤的预防、诊断及治疗的研究。1996年通过三级甲等医院评审。
院所学科设置齐全、技术力量雄厚、仪器设备先进，是国家级标志性肿瘤专科医院;具有放射治疗、外科、内科以及介入治疗、生物治疗等多种肿瘤治疗手段，在肺癌、肝癌、胰腺癌、大肠癌、乳腺癌、宫颈癌、食管癌以及头颈部肿瘤、恶性淋巴瘤等方面的诊治水平位于国内前列，在肿瘤基础研究领域已达到国际先进水平。医院设有肿瘤内科、肿瘤外科、放射治疗科等11个临床科室以及影像诊断科、检验科、核医学科等10个医技科室，拥有高能量双光子加速器、调强适形放疗、pet-ct、数字减影血管造影、全自动血液生化分析仪、核磁共振仪、肿瘤射频热疗、影像指导下的直线加速器、流式细胞仪等先进的仪器设备，万元以上设备2000余台。新病房楼的环境达到国际水平，国内一流的专家达到百人以上，特需病房充满人性化服务，优先照顾海外同胞及国际友人。全院设计床位1198张; 年门诊量41万余人次，年住院量3万余人次，年手术1万余台次。在岗职工1580余人，其中高级职称者200余人，中国科学院院士2人，中国工程院院士2人，医科院名医4名，享受政府特殊津贴73人。
院所还是全国肿瘤专业人才的重要教育基地，承担着博士生、硕士生、本科生及国内外进修生的教学任务。现有博士后流动站1个，博士点8个，硕士点10个，博士导师55人，硕士导师188人。建院四十多年以来，共培养博士后28人、博士研究生309人、硕士研究生488人以及进修生4000余人。
院所注重科学研究。设有分子肿瘤学国家重点实验室1个，北京市重点实验室1个，基础研究室4个，基础与临床应用研究中心2个，并设有为科研、临床服务的中心实验室。建院五十年来，共获科研成果170余项，其中59%为部级以上成果奖，食管癌的现场防治研究被评为1995年全国十大科技成就之一。
院所也是全国肿瘤学术交流中心，卫生部全国肿瘤防治研究办公室、卫生部全国肿瘤登记中心、卫生部肿瘤学临床医师考试中心、中国癌症研究基金会、中国抗癌协会临床肿瘤学协作中心、《中华肿瘤》杂志及《中华放射肿瘤学》杂志等均挂靠在医科院肿瘤医院。
